Los únicos indicios encontrados en el devenir histórico de la actual seccional Boyacá se remontan al año 1972, cuando fue creada como X Región, con jurisdicción en Boyacá y Cundinamarca, cuya primera delegada fue la señora Margarita Quijano Achila y posteriormente el Mayor Daniel Cárdenas Ruiz.
A partir de 1974 toma el nombre de XV Delegación Regional y recibe como delegado el Coronel Guillermo Plazas Olarte, quien permaneció en dicho cargo hasta el año de 1983.
Plazas Olarte era un destacado escritor e historiador que con posterioridad y a título honorífico dirigió el periódico de la defensa Civil en la Dirección General. Por su mística para movilizar la conciencia ciudadana, logró conformar 32 juntas de Defensa Civil, tales fueron: Soatá, El Cocuy, Puerto Boyacá, Paipa, Grupo de Apoyo Tunja, Duitama, Guateque, Moniquirá, Sogamoso, Santa Rosa de Viterbo, Chiquinquirá, El Espino, Villa de Leyva, Tipacoque, Miraflores, Tibana, Samacá, Somondoco, Paz de Río, Chiscas, Cabecera de Suescun, San Mateo, Ventaquemada, San Pablo de Borbur, Tibasosa, Boavita, Aquitania, El Manzano, Nazareth, Turmeque, San Antonio Norte y La Capilla.
En el año de 1982 se le asignó el nombre de XIII Delegación con jurisdicción en el departamento de Boyacá y la intendencia de Casanare, ésta última con el nombre de zona región.
El 23 de agosto de 1985 se realizó en la ciudad de Paipa, el Tercer Encuentro Nacional de la Defensa Civil con la participación de más de 3000 voluntarios de todo el país, asistencia del Ministro de Defensa, Viceministro de Comunicaciones, Secretario General de la Presidencia, Comandante del Ejército, Gobernador, Comandantes de Brigadas, demás autoridades regionales y locales, y del escultor maestro Rodrigo Arenas Betancourt, quien erigiera el monumento a los Lanceros de Rondón. Este Encuentro Nacional fue catalogado como excelente y el mejor que se haya realizado por su organización, número de participantes, eventos culturales, históricos, talleres y demostraciones técnicas de atención de emergencias.
Fueron también directores de la Seccional el Capitán Pedro Bernal Forero, el Mayor Alfonso Plazas Olarte, el Teniente Coronel Gustavo Alfredo Cardozo Chaparro, el Mayor Juan Félix Wells Guzmán, el Mayor Angélico Bustos Peña, Domingo Hernando Medina, el TC. Luis Fernando Piñeros y en la actualidad se encuentra al frente de la seccional el Teniente Coronel Alirio Aponte Monroy.
En 1983, la Seccional se destacó por la recolección de donaciones y dinero para los damnificados del terremoto de Popayán y construyó 6 módulos de solución para escuelas en los barrios más afectados. Durante su trayectoria la Seccional ha atendido numerosas emergencias por deslizamientos, inundaciones, accidentes vehiculares e incendios forestales, en diferentes zonas del departamento.